El delantero se formó en las filas inferiores de Racing de Montevideo. Posteriormente, afrontó un reto marchándose al Al-Shabbaab, en el que únicamente estuvo durante un año.
Durante la pasada temporada, Mauricio Affonso disputó un total de 15 encuentros con la camiseta de Peñarol, logrando anotar seis goles.
Actualmente, inicia una nueva etapa en Atlético Tucumán, que ya ha hecho oficial su traspaso a través de sus redes sociales y de su página web.
El delantero Mauricio Affonso firmó su contrato y es nuevo jugador de @ATOficial. pic.twitter.com/l4kEPENE7z
— Atlético Tucumán Of. (@ATOficial) 2 de agosto de 2017