Se había consolidado como el mediocentro titular en el equipo de Bordalás durante la primera parte de la campaña pasada. Sin embargo, un partido en el Sánchez Pizjuán el 28 de enero de 2018 cambió su carrera.
El centrocampista se rompió en aquel partido el quinto metatarsiano de su pie izquierdo, teniendo que ser sustituido a los 38 minutos de juego. Por querer volver pronto, recayó de su lesión el 7 de abril ante el Alavés.
Desde entonces, Markel Bergara no ha vuelto a pisar un campo en partido oficial tras varias lesiones más. Se fracturó el húmero en un partido amistoso con el conjunto 'azulón' y, a punto de reaparecer, se rompió el gemelo interno de la pierna izquierda hace dos meses.
Es más de un año el que lleva Markel Bergara acuciado por unas lesiones que no le han permitido volver a vestirse de corto desde abril. Demasiado tiempo para un jugador que empezó siendo importante para Bordalás.