Carlos Fernández destacó en el filial sevillista de la mano de Diego Martínez, actual entrenador del Granada, pero su propensión a las lesiones le ha impedido destacar con el primer equipo, con el que debutó en la temporada 2013-14. Desde entonces, solo ha sumado 12 encuentros oficiales -con dos goles marcados- en cinco campañas.
El curso pasado, el ariete sevillano militó como cedido en el Deportivo de la Coruña, de Segunda Sivisión, con el que cuajó una buena actuación, ya que marcó una decena de goles en los 25 partidos que disputó.
Aunque también padeció varias lesiones, fue decisivo en el buen tramo final de temporada de los coruñeses, que alcanzaron la final del 'play off' ante el Mallorca.