La trayectoria de Mullen no se ha movido prácticamente de Australia, su país de origen. Con el Adelaide United jugó varias temporadas, desde 2008 hasta 2012.
Más tarde probó suerte en la Liga China de la mano del Aerbin, aunque un año después, el Melbourne lo trajo de vuelta a casa.
Mullen ya ha cerrado su etapa con el Newcastle Jets y se incorporará en breve a su nuevo destino. Con el Wellington Phoenix ha llegado a un acuerdo hasta 2018.
PLAYER SIGNING | Delighted with the addition of this experienced & versatile defender to our squad. Welcome to Wellington, Daniel! #COYN pic.twitter.com/hchVzcsut8
— Wellington Phoenix (@WgtnPhoenixFC) 9 de agosto de 2017