A lo largo de su trayectoria profesional, Lopetegui ha estado vinculado al Rayo en varias ocasiones. Primero como portero, entre 1997 y 2002, jugando 135 partidos oficiales, y después como entrenador durante diez jornadas.
"Ojalá que se logre el objetivo de subir porque evidentemente una parte de mi corazón está y estará en el Rayo", confesó Lopetegui, que coincidió en el vestuario franjirrojo con Míchel, el actual entrenador rayista.
"Míchel es un buen amigo y un grandísimo entrenador, está haciendo un trabajo sensacional. Cogió el equipo en una situación compleja el año pasado y este año ha moldeado un equipo a su gusto futbolístico y está haciendo una temporada buenísima, jugando muy bien al fútbol", dijo Lopetegui en declaraciones a 'Onda Madrid'.
El seleccionador español se ha dejado ver últimamente alguna vez en el palco del estadio de Vallecas junto a otros dos ex jugadores rayistas, Jon Pérez Bolo y Pablo Sanz.