Llegado en el invierno de 2011 procedente del Red Bull de Salzburgo, donde militó dos campañas, Agustinussen se retira en el equipo de su vida. Formado en el Aalborg, sólo salió esos dos años que jugó en Austria.
Ha disputado hasta la fecha la friolera de 186 encuentros de liga danesa, casi 13.000 minutos, en los que ha anotado quince goles y dado cuatro asistencias.
Se retira con una liga danesa y otra austriaca en su palmarés. En la última temporada apenas ha disputado seis encuentros, únicamente dos como titular, sin jugar completo ninguno.
Consciente del declive de su carrera, Augustinussen ha decidido poner punto y final a su dilatada trayectoria en el club de su vida.