Vágner ha desarrollado la totalidad de su carrera entre Brasil y Portugal. Desde 2005 ha jugado para Atlético-PR, Paranaense, Desp. Brasil, Ituano, Estoril y el Mouscron, primera aventura 'fuera' para el portero.
A sus 30 años y con su dilatada trayectoria, el Boavista suma veteranía y experiencia a su meta para afrontar la segunda vuelta de la Liga de Portugal.
En la Jupiler Pro-League ha disputado siete partidos, en los que has encajado 16 goles.