Mitrovic firmó un contrato de cuatro años con el Brujas, equipo en el que se convirtió en imprescindible rápidamente. El club no facilitó las cifras de la operación, si bien ofreció una mejora salarial al central.
El entrenador del Brujas, Ivan Leko, manifestó su alegría por la incorporación del defensa: "Matej inmediatamente mostró sus cualidades la temporada pasada. El hecho de que haya estado con nosotros durante seis meses ya es una ventaja. Con él, la competencia aumenta, lo que siempre es bueno".
20 de julio de 2018
El croata estuvo en la lista de preseleccionados de su país para disputar el Mundial de Rusia, aunque Zlatko Dalic prescindió del futbolista cuando presentó su selección definitiva.