El 'Millonario' alcanzó la final de la Copa Sudamericana en 2003. En frente tenía a un casi desconocido Cienciano que daría la sorpresa en El Monumental, puesto que empató a tres.
En su estadio, el cuadro peruano completó un increíble partido para derrotar a River Plate por 1-0 y alzarse con el título. Un gol de falta en la segunda parte inclinó la balanza a su favor.
Esa misma temporada, Boca Juniors ganó la Copa Libertadores y soñaba con enfrentarse a su máximo rival en la Recopa Sudamericana. Y es que el 'Superclásico' de Argentina no se ha llegado a disputar en competición internacional.
Por lo tanto, el conjunto 'xeneize' se enfrentó a Cienciano, que llegaba crecido tras vencer a River Plate. Se jugó a partido único. Tras disputarse los 90 minutos, el resultado era de 1-1, por lo que se decidió en una tanda de penaltis de la que salió victorioso el cuadro peruano.
En la actualidad, la situación de Cienciano ha cambiado a peor, ya que compite en la Segunda División de Perú. Aun así, siempre contará con el lujo de haber dejado a River Plate y a Boca Juniors sin su primera final internacional entre ellos.