El equipo brasileño quedó con 9 puntos, frente a los 8 de los bolivianos y los 7 del Independiente Santa Fe colombiano, que venció por 0-2 al peruano Sporting Cristal en el otro encuentro de la fecha.
Los dos últimos se medirán por el otro cupo a octavos en Bogotá en la sexta jornada.
Santos jugó desde los 24 minutos con un hombre menos al perder por expulsión a Bruno Henrique. La baja fue sensible y la aprovechó el The Strongest, que abrió la cuenta con un golazo del máximo anotador de la Libertadores, Alejandro Chumacero, a los 40 minutos.
Sin embargo, el conjunto santista se adueñó de la pelota y en un segundo tiempo en el que mandó en el campo del estadio Hernando Siles empató con gol de Vitor Bueno a los 68 minutos.
El The Strongest falló un penalti a poco del final pues Pablo Escobar tiró la pelota por encima de la puerta de Vanderlei.