Los blanquiazules se medirán al Nitra en un doble duelo que se disputará entre el 28 de septiembre y el 19 de octubre. En la segunda ronda le esperaría el Anderlecht o el Midtjylland, duelos que se disputarían entre el 2 y el 23 de noviembre.
Los emparejamientos de la primera ronda ha sido los siguientes:
Nitra (SVK) - Málaga (ESP)
Puskás Academy Felcsút (HUN) - PAOK (GRE)
APOEL (CYP) - Roma (ITA)
Domžale (SVN) - Čukarički (SRB)
Breidablik (ISL) - Ajax (NED)
HJK Helsinki (FIN) - Cork City (IRL)
Anderlecht (BEL) - Midtjylland (DEN)
Rosenborg (NOR) - AIK (SWE)
Viitorul (ROU) - Sheriff Tiraspol (MDA)
Zrinjski Mostar (BIH) - FC Zürich (SUI)
Salzburg (AUT) - Vardar (MKD)
Sparta Praha (CZE) - Mladost Podgorica (MNE)
Qäbälä (AZE) - Dinamo Moskva (RUS)
Maccabi Haifa (ISR) - Shakhtyor Soligorsk (BLR)
Dinamo Tbilisi (GEO) - Kairat Almaty (KAZ)
Altinordu (TUR) - Levski Sofia (BUL)
Para la segunda ronda, estos serían los emparejamientos:
Puskás Academy Felcsút (HUN)/PAOK (GRE) - Breidablik (ISL)/Ajax (NED)
APOEL (CYP)/Roma (ITA) - HJK Helsinki (FIN)/Cork City (IRL)
Nitra (SVK)/Málaga (ESP) - Anderlecht (BEL)/Midtjylland (DEN)
Rosenborg (NOR)/AIK (SWE) - Domžale (SVN)/Čukarički (SRB)
Altinordu (TUR)/Levski Sofia (BUL) - Sparta Praha (CZE) v Mladost Podgorica (MNE)
Viitorul (ROU)/Sheriff Tiraspol (MDA) - Zrinjski Mostar (BIH)/FC Zürich (SUI)
Maccabi Haifa (ISR)/Shakhtyor Soligorsk (BLR) - Qäbälä (AZE)/Dinamo Moskva (RUS)
Salzburg (AUT)/Vardar (MKD) - Dinamo Tbilisi (GEO)/Kairat Almaty (KAZ)
A partir de ahí, los ocho vencedores se unirán a los segundos clasificados de la ronda de grupos que llegan desde la ruta Champions League.