El equipo castellonense ha visitado en torneos continentales al Málaga, Valencia, Atlético de Madrid y Sevilla, con un balance de un empate y tres derrotas.
En su primera participación europea, temporada 2002-2003, se enfrentó a su primer rival español. Entonces el Villarreal empató a uno ante el Málaga en La Rosaleda en el partido de ida y sucumbió en El Madrigal por 0-1.
Al año siguiente, el Valencia fue el rival en las semifinales de la Copa de la UEFA y entonces también sucumbió por la mínima 1-0 en Mestalla.
En la temporada 2004-2005 venció al Atlético de Madrid en la final de la Intertoto, aunque había perdido en el Vicente Calderón por 2-0 en la vuelta y conquistó el título en la tanda de penaltis.
Su última visita fue al Sevilla en la campaña 2014-2015, donde cayó por la mínima 2-1 tras haber sido goleado en la ida por 1-3.