Después de la debacle de Boca en la 'Superfinal' estaba claro que el equipo necesitaba un cambio de aires. De este modo y como una de las figuras más señaladas, Pablo Pérez salió del 'Xeneize' en busca de un clima renovado en el que seguir desarrollando su fútbol.
Ariel Holan, entrenador de Independiente, lo reclutó para el centro del campo del 'Rojo' y con menos de dos semanas de entrenamientos con el equipo debutó en partido oficial con la reanudación de la Superliga.
El sexto clasificado en Argentina empató con Talleres en su vuelta al césped, pero el ex capitán de Boca completó un gran partido que le llevó a recibir el reconocimiento de la afición en el Estadio Libertadores de América.
A pesar de las dos ocasiones desperdiciadas, el nuevo número '8' de Independiente se despidió entre aplausos tras ser sustituido en el minuto 61 de encuentro.